Okulumuz A ve B Blok olmak üzere 2 binada eğitim-öğretimi sürdürmektedir.
A Blok 1973/1974 eğitim öğretim yılında hizmete açılmış, ilk mezunlarını 1975/1976 öğretim yılında vermiş ve günümüze kadar kesintisiz eğitime devam etmiştir.
Bünyesinde ortaokulla birlikte eğitim öğretim yapılırken öğrenci mevcudunun artması sonucunda derslik yetersizliği baş göstermiştir. Alaaddin mahallesinde bugün Erdek Anadolu lisesi olarak faaliyetini sürdüren binanın Erdek Lisesi Öğrencilerini koruma ve yaşatma derneği tarafından yapımına başlanmıştır. 1983 Yılında Erdek'te meydana gelen deprem nedeni ile Atatürk İlköğretim Okulu olarak kullanılan binada Ortaokul ile birlikte eğitim ve öğretime devam edilmiştir
1984-1988 yılları arasında Alaaddin Mahallesindeki Erdek ortaokulu ile birlikte eğitim öğretime devam edilmiştir.
1988 yılında Atatürk İlköğretim okulunun onarımının tamamlanması sonucu ortaokul bölümü (6-7-8.sınıflar) bulundukları binada kalmış ve Erdek Lisesi 1973 yılında eğitim öğretime başladığı Yalı Mahallesi Ortaokul caddesindeki binasına taşınmıştır.
Erdek lisesi 2003-2004 eğitim öğretim yılında 30 öğrenci kontenjanı ile Erdek Yabancı dil ağırlıklı Lise uygulamasına geçmiştir, bu uygulama sadece 2 eğitim öğretim yılı devam etmiştir.
Genel Liselerin kademeli olarak Anadolu Lisesine veya Meslek Lisesine dönüştürülmesi nedeniyle 2013-2014 Eğitim ve Öğretim Yılından itibaren Erdek Ticaret Meslek Lisesi olarak kademeli geçiş sağlanmıştır. 2014-2015 Eğitim Öğretim Yılından itibaren de isim değişikliği yapılarak Kapıdağ Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi İsmini almıştır.
B Blok Anıtlar Kurulu koruması altında bulunan tarihi bir binadır.
B blok Rumlardan kalma Metropolit(Başpapaz) Kilisesi 1879 yılında inşa edildiği tahmin edilmekte olup, 1937 yılında onarılarak Belediye binası olarak kullanılmış ve 17 Ekim 1949 yılında hazineye devredilerek ortaokul olarak hizmet vermiştir.
26/09/1968 tarihinden itibaren 832 sıra sayılı emir doğrultusunda Milli Eğitim Bakanlığına tapulu tahsis edilmiştir ve Maliye Hazinesine aittir. Bu tarihten itibaren Pratik Kız Sanat Okulu olarak eğitim-öğretime başlamıştır 1980-1981 öğretim yılında Kız Meslek Lisesi, 2008-2009 öğretim yılından itibaren Kız Teknik ve Meslek Lisesi olarak eğitim-öğretime devam etmiştir.
2014-2015 Eğitim-Öğretim yılında Erdek Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi olarak isimlendirilmiştir.
2016-2017 Eğitim ve Öğretim yılında aynı bahçe içinde eğitim-öğretim hizmeti veren Kapıdağ Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi ile Erdek Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi, Kapıdağ Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi adı altında birleşmiştir.